Caractérisation des bactériophages lytiques vis-à-vis des E. coli pathogènes : spécificité des récepteurs, efficacité in vivo et analyse génomique

Article par M. Ricky Thaper 

Publié le 1er octobre 2023

L’entreprise SyntBioLab basée à Lévis, au Québec (Canada), fait un travail de pionnier en proposant des alternatives aux antibiotiques pour une croissance saine du secteur de l’élevage. Après avoir renforcé sa présence au Canada, aux États-Unis et en Europe, l’entreprise cherche à étendre sa présence en Asie, y compris en Inde.

 

Les antibiotiques sont utilisés depuis de nombreuses décennies dans l’élevage des volailles. La production mondiale de bétail continue d’enregistrer une forte croissance annuelle à mesure que le modèle industrialisé de production de bétail et de poisson s’étend à plusieurs continents, dont l’Asie, la volaille représentant une part de plus en plus importante de la production de viande dans le monde. Cependant, la résistance aux antimicrobiens est en train de devenir un problème majeur dans l’industrie de la volaille. Cette utilisation croissante d’antibiotiques a suscité une inquiétude accrue quant au développement de la résistance aux antibiotiques dans l’industrie de la volaille.  La surconsommation d’antibiotiques chez les animaux élevés pour la viande est liée à l’augmentation des infections résistantes aux antibiotiques, non seulement chez les animaux, mais aussi chez les humains et dans l’environnement.

 

Lors de ma récente visite au Canada, j’ai eu l’occasion de visiter les installations ultramodernes de SyntBioLab à Lévis, Québec, Canada, une société de bio-ingénierie qui développe des antimicrobiens alternatifs contre les bactéries pathogènes affectant le bétail. L’entreprise créée en 2013 utilise des bactériophages pour lutter contre les bactéries qui infectent le bétail. Ils assurent la santé animale et la sécurité publique en évitant la résistance aux antibiotiques. Elle utilise des bactériophages pour lutter contre les bactéries qui infectent le bétail, y compris les volailles. Ils contribuent à la santé animale et à la sécurité publique en évitant la résistance aux antibiotiques. L’entreprise se concentre sur le développement de solutions naturelles, uniques et innovantes qui sont des solutions efficaces pour résoudre les problèmes. SyntBioLab a une forte culture de l’excellence qui est transposée par son équipe dans ses produits à haute valeur ajoutée pour l’industrie.

 
Photo 1: Mr. Ricky Thaper with SyntBioLab Inc Senior Management Team in their office at Lévis, Quebec, Canada

De nombreuses facettes de la vie humaine sont affectées par les pathogènes bactériens. Les bactéries peuvent être à l’origine de maladies animales et végétales. L’utilisation intensive d’antibiotiques pour lutter contre les bactéries pathogènes a entraîné une augmentation de la multi-résistance aux antimicrobiens. Même lorsque les antibiotiques sont utilisés avec vigilance, leur application à la volaille ou à d’autres domaines de la production animale peut entraîner une propagation accrue de la résistance aux médicaments. Les adversaires naturels des bactéries – les bactériophages – sont désormais considérés comme une alternative aux antibiotiques. La réduction de l’utilisation des antibiotiques est également importante, car la diminution de l’utilisation des antibiotiques dans le bétail devrait limiter l’augmentation de l’émergence d’E. coli résistants aux antibiotiques et d’autres bactéries associées à des infections d’origine alimentaire chez l’homme.

En tant que partenaire industriel, SyntBioLab vise la possibilité d’une production à grande échelle et la commercialisation d’un tel produit. La société affirme que l’isolement de ces bactériophages et le développement d’une alternative efficace aux antibiotiques constitueraient un avantage certain pour l’organisation partenaire.  L’entreprise est dirigée par M. Rodrigue Dubar, président et chef de la direction du conseil d’administration et fondateur depuis 2013, qui est très expérimenté et passionné. Il est titulaire d’un baccalauréat en sciences appliquées, Biochimie de l’Université Laval, Québec, Canada.

Selon M. Dubar, le projet de SyntBioLab Inc est d’identifier et de caractériser des bactériophages (virus bactériens) qui peuvent réduire la présence de la bactérie E. coli qui est une cause importante de maladie et de perte de production pour l’industrie de la volaille. La réduction des niveaux d’E. coli pouvant causer des maladies chez les volailles par l’utilisation de bactériophages serait un moyen important de contrôler cette maladie économiquement importante et de réduire l’utilisation d’antibiotiques pour contrôler ces infections.

Photo 2 : Sur la photo de groupe (de gauche à droite), M. Nicolas Lemire, directeur de projet, M. Rodrigue Dubar, président-directeur général, M. Ricky Thaper, M. Simon Labrie, directeur scientifique et M. Viacheslav Liato, directeur de production, dans leur laboratoire très bien établi.

Les solutions de rechange aux antibiotiques utilisant des bactériophages offrent des services d’optimisation métabolique à haut débit liés aux microorganismes industriels, permettant aux scientifiques de développer de nouvelles souches de bactéries qui améliorent les procédés de fabrication, en particulier dans l’industrie laitière, la production de protéines et le biocontrôle des populations bactériennes. M. Simon Labrie, directeur scientifique et associé de la société, a été chercheur postdoctoral au Chisholm Lab, Massachusetts Institute of Technology, et détient un doctorat en microbiologie de l’Université Laval (Québec). Il a dix-neuf ans d’expérience dans la recherche sur les phages. Il conçoit actuellement des solutions basées sur les phages pour remplacer les antibiotiques dans l’industrie de l’élevage et de l’alimentation. M. Labrie a expliqué que les bactériophages lytiques (phages) sont des virus spécifiques aux bactéries qui peuvent lyser et tuer leurs cibles bactériennes. Contrairement aux antibiotiques qui tuent à grande échelle, les bactériophages ne tuent que des espèces ou des souches bactériennes spécifiques et sont inoffensifs pour les autres. L’un des objectifs de l’entreprise est de développer des applications pour contrôler les pathogènes bactériens à l’aide de phages. Escherichia coli est un problème majeur pour la sécurité alimentaire et la santé animale. En particulier, chez les volailles, notamment les poulets et les dindes, Escherichia coli pathogène aviaire (APEC) est la cause prédominante d’infections respiratoires et systémiques.

Viacheslav Liato, directeur de production, et M. Nicolas Lemire, chef de projet, travaillent avec passion à l’expansion de la présence de l’entreprise dans le monde entier. Les solutions de SyntBioLab visent principalement à limiter l’impact d’Escherichia coli dans les productions avicoles. M. Liato a déclaré que les pathogènes bactériens importants pour la santé animale et la sécurité alimentaire ont un impact majeur sur l’agriculture et les industries alimentaires dans le monde entier. On observe une augmentation de la résistance bactérienne aux antimicrobiens et de l’utilisation d’antibiotiques dans les secteurs de l’élevage et de la volaille. Ce phénomène est attribué à la probabilité d’une résistance accrue aux antimicrobiens. D’autres stratégies sont donc nécessaires pour lutter contre les bactéries pathogènes dans la chaîne de production alimentaire.

Photo 3 : M. Ricky Thaper avec Mme Julianne Langlais, directrice du développement des affaires, M. Rodrigue Dubar, président-directeur général et M. Simon Labrie, directeur scientifique, SyntBioLab, dans leurs installations de production hautement sophistiquées au Québec, Canada.

Mme Julianne Langlais, directrice du développement des affaires de l’entreprise, poursuit sans relâche l’expansion de l’entreprise dans le monde entier. Mme Langlais a indiqué que la société avait également déposé une demande de brevet sur le thème “Composition de bactériophages et méthode de prévention des infections bactériennes chez le bétail”. Après s’être établie aux États-Unis, au Canada et sur les marchés européens, l’entreprise cherche à étendre la présence de ses produits dans les pays d’Asie, y compris en Inde.

L’industrie avicole indienne connaissant une croissance annuelle d’environ 7 à 8 %, la solution fournie par SyntBioLab Inc. pourrait contribuer à la croissance durable du secteur avicole indien en protégeant les volailles contre la résistance aux antimicrobiens. M. Rodrigue Dubar, président, a indiqué que la société cherchait à travailler avec ses homologues indiens pour étendre sa présence ici et aider les éleveurs de volailles, les producteurs laitiers et les aquaculteurs à améliorer leur productivité grâce à des produits uniques qui améliorent la santé des volailles.